El Palacio de la Antigua Escuela de Medicina alberga:
1. El Departamento de Historia y Filosofía de la Medicina
2. El Museo de la Medicina Mexicana
3. El Archivo Histórico de la Facultad de Medicina
4. La Biblioteca Histórico-médica "Dr. Nicolás León"
5. Una librería de libros antiguos principalmente.
El Departamento de Historia y Filosofía de la Medicina, el Archivo y la Biblioteca, fueron creados por el doctor Francisco Fernández del Castillo (1899-1984) en 1956. Se iniciaron en las instalaciones de la Facultad de Medicina en la Ciudad Universitaria y desde 1980 se encuentran el el Palacio de la Antigua Escuela de Medicina. El Museo de la Medicina Mexicana existe también desde 1980 y la librería empezó en el Palacio en 1991 y es conducida por la señora Amalia Porrúa.